Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA4P05014 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms