Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZBED1O96006 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms