Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1O95476 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTDNEP1O95476 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDNEP1O95476 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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