Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG12O94817 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG12O94817 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG12O94817 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms