Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKAP2O75563 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKAP2O75563 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms