Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2F6O75461 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F6O75461 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F6O75461 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F6O75461 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F6O75461 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F6O75461 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F6O75461 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2F6O75461 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2F6O75461 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2F6O75461 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms