Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NIPSNAP2O75323 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP2O75323 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms