Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTNSO60931 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNSO60931 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms