Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIAA0556O60303 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIAA0556O60303 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms