Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP2AO43633 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP2AO43633 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP2AO43633 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP2AO43633 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP2AO43633 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP2AO43633 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP2AO43633 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHMP2AO43633 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHMP2AO43633 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHMP2AO43633 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHMP2AO43633 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms