Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF14O43557 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms