Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTIFO43310 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTIFO43310 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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