Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGSM2O43147 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SGSM2O43147 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms