Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms