Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD28O15084 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms