Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP290O15078 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP290O15078 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP290O15078 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP290O15078 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP290O15078 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP290O15078 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP290O15078 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP290O15078 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP290O15078 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CEP290O15078 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms