Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNMO15061 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNMO15061 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNMO15061 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYNMO15061 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNMO15061 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNMO15061 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNMO15061 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNMO15061 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNMO15061 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNMO15061 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNMO15061 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNMO15061 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms