Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEMA3EO15041 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms