Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
E2F3O00716 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E2F3O00716 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
E2F3O00716 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms