Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIP1O00291 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HIP1O00291 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIP1O00291 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIP1O00291 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIP1O00291 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIP1O00291 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms