Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT5HO00267 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT5HO00267 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SUPT5HO00267 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SUPT5HO00267 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SUPT5HO00267 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SUPT5HO00267 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SUPT5HO00267 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SUPT5HO00267 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SUPT5HO00267 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SUPT5HO00267 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SUPT5HO00267 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SUPT5HO00267 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SUPT5HO00267 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SUPT5HO00267 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SUPT5HO00267 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms