Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2K7ER74 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms