Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC01387J3KSC0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms