Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E9PBE3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E9PBE3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E9PBE3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E9PBE3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms