Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP17L21D6R901 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms