Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L5A8MUK1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L5A8MUK1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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