Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00473A8K010 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms