Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GOLGA8JA6NMD2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GOLGA8JA6NMD2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms