Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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