Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
MKRN3Q13064 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
MKRN3Q13064 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms