Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD11P31277 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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