Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.6 ms