Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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