Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms