Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms