Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF6Q9Y4K3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms