Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KCNIP3Q9Y2W7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms