Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms