Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FARSAQ9Y285 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms