Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCQ9Y266 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCQ9Y266 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms