Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NOD1Q9Y239 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms