Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms