Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHA12Q9UN75 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHA12Q9UN75 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms