Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms