Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHIC2Q9UKJ5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms