Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TNIKQ9UKE5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TNIKQ9UKE5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms