Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXTL2Q9UBQ6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL2Q9UBQ6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms