Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DKK3Q9UBP4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms