Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRP2BPQ9P2M1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRP2BPQ9P2M1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms