Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms